Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms