Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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