Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms