Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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