Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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