Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms