Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms