Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
JrkQ60976 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms