Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Helb-201ENSMUST00000020449 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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