Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Hdgfl2Q3UMU9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdgfl2Q3UMU9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdgfl2Q3UMU9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdgfl2Q3UMU9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdgfl2Q3UMU9 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdgfl2Q3UMU9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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