Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms