Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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