Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Q3U6N9 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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