Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf149Q3U2C5 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf149Q3U2C5 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf149Q3U2C5 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf149Q3U2C5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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