Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm16304-201ENSMUST00000129972 775 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 H2-M5-203ENSMUST00000169189 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm2324-201ENSMUST00000187464 662 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Psme1-201ENSMUST00000089619 711 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 AC159244.2-201ENSMUST00000222051 220 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Pfdn4-202ENSMUST00000075087 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Mir181c-201ENSMUST00000083549 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Gm43340-201ENSMUST00000200448 1344 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ush2AQ2QI47 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms