Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms