Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms