Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms