Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms