Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms