Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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NfiaQ02780 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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NfiaQ02780 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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NfiaQ02780 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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NfiaQ02780 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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NfiaQ02780 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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NfiaQ02780 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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