Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms