Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gbx1P82976 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gbx1P82976 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gbx1P82976 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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