Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gfi1P70338 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gfi1P70338 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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