Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tra2bP62996 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms