Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms