Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms