Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CdaP56389 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CdaP56389 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CdaP56389 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms