Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms