Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms