Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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