Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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