Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Dusp1P28563 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Dusp1P28563 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms