Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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