Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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