Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lama1P19137 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Lama1P19137 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Lama1P19137 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms