Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18530 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms