Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TsksO54887 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TsksO54887 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms