Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms