Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm17577J3QNF7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm17577J3QNF7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm17577J3QNF7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm17577J3QNF7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm17577J3QNF7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm17577J3QNF7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm17577J3QNF7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm17577J3QNF7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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