Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms