Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Taf4bG5E8Z2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Taf4bG5E8Z2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Taf4bG5E8Z2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Taf4bG5E8Z2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Taf4bG5E8Z2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms