Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Usp9yF8VPU6 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp9yF8VPU6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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