Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hectd4E9Q2E4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms