Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms