Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ssxb8B1AY40 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ssxb8B1AY40 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ssxb8B1AY40 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ssxb8B1AY40 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ssxb8B1AY40 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ssxb8B1AY40 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ssxb8B1AY40 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ssxb8B1AY40 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ssxb8B1AY40 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssxb8B1AY40 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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