Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp36B1AQJ2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms