Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Skint4A7TZF3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms