Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms