Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms